La investigació relacionada amb el Museu ha generat des dels seus inicis un cos bibliogràfic de més d'un centenar de títols amb els resultats publicats en diverses revistes cientifiques nacionals i internacionals.

L'Associació publica el Butlletí Aubaïna (ISSN 1576-4206), el qual inclou informació sobre les activitats del museu, adquisions, exposicions i projectes,notes faunístiques i florístiques , articles de divulgació, entre d'altres. A més, el museu edita un altra tipus de publicacions que tenen per objecte divulgar qualsevol temàtica relacionada amb les ciències naturals.