Colección Juan Bauzá Rullan
Está formada por un número elevado de ejemplares fósiles (ca. 35.000) tanto de las Islas Baleares como de otras procedencias. En la colección está representado el registro fósil de las Baleares, desde el Carbonífero hasta el Cuaternario con especial atención a la ictiofauna fósil. Un apartado de la colección está dedicado a los otolitos de peces actuales para estudios de comparación.
El fondo documental incluye una biblioteca especializada, con obras clásicas y trabajos antiguos sobre paleoictiología, diversas colecciones de revistas, así como todos los trabajos publicados por el titular de la colección. Además, incluye un fichero manual de bibliografía y de los materiales fósiles. La colección, de titularidad municipal, incluye material pendiente de revisión.
Altres Col·leccions
Col·lecció general
Aquesta col·lecció reuneix tots els materials generats pel Museu des de la seva fundació així com les col·leccions donades o dipositades per investigadors independents o per altres persones o institucions.
Col·lecció Guillem Colom Casasnovas
Aquesta col·lecció reuneix tots els materials generats pel Museu des de la seva fundació així com les col·leccions donades o dipositades per investigadors independents o per altres persones o institucions.
Col·lecció William Waldren
Aquesta singular col·lecció està formada per un nombre important de restes fòssils de Myotragus balearicus Bate, un arctiodàctil endèmic de les Balears que s’extingí coincidint amb el poblament humà de l’arxipèlag.