Col·lecció William Waldren
Esta singular colección está formada por un importante número de restos fósiles de Myotragus balearicus Bate, un artiodáctilo endémico de las Islas Baleares que se extinguió coincidiendo con el poblamiento humano del archipiélago. El titular de la colección es el DAMARC (Deià Archaeological Museum) que fundó el Dr. Waldren y se encuentra en situación de depósito permanente en el Museu Balear de Ciències Naturals para su correcta conservación. Todo el material, actualmente en proceso de tratamiento museológico y catalogación, procede de las excavaciones realizadas por William Waldren y sus colaboradores en la cueva de Muleta (Puerto de Sóller, Mallorca). Se trata del conjunto de restos fósiles de Myotragus balearicus más importante del mundo en cuanto al número de ejemplares que contiene.
Altres Col·leccions
Col·lecció general
Aquesta col·lecció reuneix tots els materials generats pel Museu des de la seva fundació així com les col·leccions donades o dipositades per investigadors independents o per altres persones o institucions.
Col·lecció Juan Bauzá Rullan
Està formada per un nombre elevat d’exemplars fòssils (ca. 35.000) de Balears i d’altres procedències.
Col·lecció Guillem Colom Casasnovas
Aquesta col·lecció reuneix tots els materials generats pel Museu des de la seva fundació així com les col·leccions donades o dipositades per investigadors independents o per altres persones o institucions.